สำนักบริหารพื้นที่อนุรักษ์ที่ 6 รับผิดชอบพื้นที่ป่าอนุรักษ์ใน 5 จังหวัด ได้แก่ สงขลา พัทลุง ปัตตานี ยะลา และนราธิวาส โดยมีสำนักฯ สาขาปัตตานี รับผิดชอบด้านการจัดการในพื้นที่จังหวัดปัตตานี ยะลา และนราธิวาส