จัดตั้งขึ้นเพื่อนำผลการศึกษาและพัฒนาในด้านต่างๆ ทั้งในด้านอุทยานแห่งชาติทางบก อุทยานแห่งชาติทางทะเล การจัดการต้นน้ำ นำมาวิเคราะห์ ทดลอง สาธิต และศึกษาวิจัยหารูปแบบของการพัฒนาการจัดการอุทยานแห่งชาติทางทะเลที่เหมาะสมที่สุด เพื่อให้สอดคล้องกับแนวทางการพัฒนาทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมในยุคโลกาภิวัตรและก่อให้เกิดการพัฒนาอุทยานแห่งชาติที่ยั่งยืนตลอดไป โดยมีหน้าที่ศึกษาและพัฒนารูปแบบการบริหารจัดการ และวางแผนการพัฒนาอุทยานแห่งชาติทางทะเลที่ได้มาตรฐาน ส่งเสริมรูปแบบการจัดการอุทยานแห่งชาติแบบมีส่วนร่วมของชุมชนและผู้เกี่ยวข้องแบบบูรณาการ ศึกษาและดำเนินการกำหนดแนวทางในการจัดการและฟื้นฟูทรัพยากรธรรมชาติ เพื่อเป็นแหล่งในการศึกษาวิจัยและการศึกษาธรรมชาติ เป็นศูนย์ฝึกอบรมให้ความรู้ในการจัดการอุทยานแห่งชาติและทางทะเลแห่งภูมิภาคเอเซียแปซิฟิก เป็นศูนย์สาธิตและแหล่งศึกษาดูงานด้านการจัดการอุทยานแห่งชาติทางทะเล ของหน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน และระดับนานาชาติ พัฒนาและจัดบริการการศึกษาธรรมชาติ และการให้ข้อมูลนักท่องเที่ยว และปฏิบัติงานหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย